Dr. Beate Slaby

Dr. Beate Slaby

Forschungsbereich 3: Marine Ökologie
FE Marine Symbiosen

Büro:
Raum: HB-124 (Hohenbergstraße 2)
Telefon: +49 431 600-4470
Fax: +49 431 600-4482
Email: bslaby(at)geomar.de

Post-Adresse:
Düsternbrooker Weg 20, 24105 Kiel

 

 

      

Wissenschaftlicher Werdegang

  • seit 2019: Koordinatorin Programmorientierte Förderung (POF) IV Topic 6
  • seit 2017: Postdoc im Horizon 2020 EU-Projekt SponGES
  • am GEOMAR seit Juli 2015
  • 20132017: Promotion im Programm “Life Sciences” der Graduate School of Life Sciences, Julius-Maximilians-Universität Würzburg
  • 2010 – 2012: Masterstudium “Geological Sciences” von LMU und TU München
  • 2007 – 2010: Bachelorstudium “Geosciences” von LMU und TU München

Forschungsinteressen

  • 'Omics' unkultivierter Microorganismen
  • Interaktion von Microorganismen mit marinen Schwämmen
  • Bioinformatische Methoden

Publikationen

Slaby BM, Franke A, Rix L, Pita L, Bayer K, Jahn MT, Hentschel U (2019) Marine Sponge Holobionts in Health and Disease. In: Li Z, editor. Symbiotic Microbiomes of Coral Reefs Sponges and Corals. Dordrecht: Springer Netherlands. p.81-104. https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-94-024-1612-1_7

Karimi E, Keller-Costa T, Slaby BM, Cox CJ, da Rocha UN, Hentschel U, Costa R (2019) Genomic blueprints of sponge-prokaryote symbiosis are shared by low abundant and cultivatable Alphaproteobacteria. Scientific Reports. https://www.nature.com/articles/s41598-019-38737-x

Bayer K, Jahn MT, Slaby BM, Moitinho-Silva L, Hentschel U (2018) Marine Sponges as Chloroflexi Hot Spots: Genomic Insights and High-Resolution Visualization of an Abundant and Diverse Symbiotic Clade. mSystems. https://msystems.asm.org/content/3/6/e00150-18 and preprint on bioRxiv https://www.biorxiv.org/content/early/2018/05/22/328013

Karimi E, Slaby BM, Soares AR, Blom J, Hentschel U, Costa R (2018) Metagenomic binning reveals versatile nutrient cycling and distinct adaptive features in alphaproteobacterial symbionts of marine sponges. FEMS Microbiology Ecology. https://academic.oup.com/femsec/advance-article/doi/10.1093/femsec/fiy074/4985835

Pita L, Rix L, Slaby BM, Franke A, Hentschel U (2018) The sponge holobiont in a changing ocean: from microbes to ecosystems. Microbiome. https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-018-0428-1

Astudillo-García C, Slaby BM, Waite DW, Bayer K, Hentschel U, Taylor MW (2017) Phylogeny and genomics of SAUL, an enigmatic bacterial lineage frequently associated with marine sponges. Environmental Microbiology. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1462-2920.13965/abstract

Slaby BM, Hackl T, Horn H, Bayer K, Hentschel U (2017) Metagenomic binning of a marine sponge microbiome reveals unity in defense but metabolic specialization. The ISME Journal 11:2465-2478. http://dx.doi.org/10.1038/ismej.2017.101

Slaby BM (2017) Exploring the microbiome of the Mediterranean sponge Aplysina aerophoba by single-cell and metagenomics / Untersuchungen am Mikrobiom des Mittelmeerschwamms Aplysina aerophoba mittels Einzelzell- und Metagenomik. Dissertation. http://oceanrep.geomar.de/35286/

Slaby BM, Hentschel U (2017) Draft Genome Sequences of "Candidatus Synechococcus spongiarum," Cyanobacterial Symbionts of the Mediterranean Sponge Aplysina aerophoba. Genome Announcements 5:e00268-17. genomea.asm.org/lookup/doi/10.1128/genomeA.00268-17

Horn H, Slaby BM, Jahn MT, Bayer K, Moitinho-Silva L, Förster F, Abdelmohsen UR, Hentschel U (2016) An Enrichment of CRISPR and Other Defense-Related Features in Marine Sponge-Associated Microbial Metagenomes. Frontiers in Microbiology 7:1751. journal.frontiersin.org/article/10.3389/fmicb.2016.01751/full

Burgsdorf I, Slaby BM, Handley KM, Haber M, Blom J, Marshall CW, Gilbert JA, Hentschel U, Steindler L (2015) Lifestyle Evolution in Cyanobacterial Symbionts of Sponges. mBio 6(3): e00391-15. mbio.asm.org/content/6/3/e00391-15

Bayer K, Slaby B, Hentschel U (2015) Den Unkultivierbaren auf der Spur. BIOspektrum 21(1): 17-19. www.biospektrum.de/ausgabe/1-2015/1330594

Beiträge zu Konferenzen

  • YOUMARES 9, Oldenburg, Germany (Vortrag)
  • ISME17, Leipzig, Germany (Poster)
  • Marine 'omics Workshop, Delmenhorst, Germany (Vortrag)
  • YOUMARES 8, Kiel, Germany (Vortrag)
  • 10th World Sponge Conference, Galway, Ireland (Vortrag)
  • Gordon Research Conference Animal-Microbe Symbioses, West Dover, VT, USA (Poster)
  • Young Investigator Research Day, Kiel, Germany (Vortrag)
  • Essential Ocean Variables Workshop, Kiel, Germany (Poster)
  • Eureka!, 10th International Symposium Organized by the Students of the GSLS, Wuerzburg, Germany (Poster)
  • Gordon Research Conference Applied & Environmental Microbiology, South Hadley, MA, USA (Kurzvortrag und Poster)
  • 2nd Global Invertebrate Genomics Alliance (GIGA) Workshop, Munich, Germany (Poster)
  • 2nd International Symposium on Sponge Microbiology, Baltimore, MD, USA (Poster)
  • Eureka!, 9th International Symposium Organized by the Students of the GSLS, Wuerzburg, Germany (Poster)
  • 9th Annual DOE JGI User Meeting, Walnut Creek, CA, USA (Poster)
  • SCIX Scientific Crosstalk, 8th International Symposium Organized by the Students of the Graduate School of Life Sciences, Wuerzburg, Germany (Poster)

Öffentliche Vorträge

  • Naturerlebniszentrum Maasholm 2018: Slaby B. "Schwämme: die Methusaleme der Meere"
  • Kieler Woche 2017: Slaby B. "Schwämme: Methusaleme der Meere"
  • Kinder- und Schüleruni Kiel 2017: Hentschel U, Slaby B, Jung S. "Meeresschwämme und Mikroorganismen: Pioniere der Evolution"

Auszeichnungen

  • 06/2017: Reisekostenbeihilfe der GlaxoSmithKline (gsk) Stiftung für die 10th World Sponge Conference, Galway, Irland
  • 02/2013-01/2016: Promotionsstipendium der Graduate School of Life Sciences (GSLS) der Julius-Maximilians-Universität Würzburg

Lehrerfahrung

  • 2018: Betreuung von Praktikanten
  • 2017: Betreuung von Praktikanten
  • 2013: Betreuung einer Bachelorarbeit, Würzburg
  • 2012-2014: Betreuung von Laborpraktika, München und Würzburg

Ausfahrten

  • Aug/Sep 2019: MSM86 auf RV "Maria S. Merian" (Probennahme an arktischen Tiefseeschwämmen)
  • 2016: PS101 auf RV "Polarstern" (Probennahme an arktischen Tiefseeschwämmen)
  • 2012: SO224 auf RV “Sonne” (Betreuung des Parasound-Systems, Sedimentecholot)
  • 2009: ANT XXV/5 auf RV “Polarstern” und MSM12/2 auf RV “Maria S. Merian” (Betreuung des Parasound-Systems, Sedimentecholot, Unterstützung bei der Sedimentkern-Beprobung)